Röntgendiffrakció oktatási segédanyagok ELTE Kémiai Intézet Szerkezeti Kémia és Biológia Laboratórium MTA-ELTE Fehérjemodellező Kutatócsoport

Segédanyagok a Röntgendiffrakciós szerkezetvizsgálat című internetes jegyzethez (TÁMOP-4.1.2.A/1-11/1-2011-0025), és a kapcsolódó gyakorlati kurzusokhoz:
· Lizozim szerkezetmegoldása Harmat Veronika, ELTE Kémiai Intézet Tyúktojásból származó lizozim tetragonális kristályáról készült diffrakciós képek; adatfeldolgozás XDS és iMosflm programokkal; molekuláris helyettesítés és szerkezetfinomítás a CCP4 programcsomaggal (MOLREP és Refmac); modellépítés Coot programmal (a szerkezetmegoldás gyakorlati lépéseinek részletesebb leírás a jegyzet 15. fejezetében). A felhasznált programok elérhetősége a mellékelt szöveges fájlokban található. A felhasznált programokról részletesebben: Kabsch, W., Acta Cryst. D66, 125, 2010 Collaborative Computational Project Number 4, Acta Cryst. D50:760, 1994 Vagin, A., Teplyakov, A., J. Appl. Cryst. 30, 1022, 1997 Emsley, P., Cowtan K., Acta Cryst D60, 2126, 2004 Murshudov, G.N., Vagin, A.A., Dodson, E.J., Acta Cryst. D53, 240, 1997
· Ruténiumkomplex szerkezetének megoldása (kismolekula szerkezetmegoldása) Bényei Attila, Debreceni Egyetem Fizikai Kémiai Tanszék A Ru(H2O)6(tos)2 és NMPTA(tos) reakciójával kapott vegyület szerkezetmeghatározása és szerkezetvalidálása (tos: tozilát; NMPTA: 1,3,5-triaza-7-foszfatriciklo-[3.3.1.1.^3,7]dekán N-metil kationja). Adatredukció; Fázisprobléma megoldása, modellépítés, finomítás (WINGX program); CIF fájl készítése; validálás (pl. checkcif szerver); értelmezés (PLATON, ORTEP). A szerkezetről részletesebben: Kovacs J., Joo F., Benyei A.C., Laurenczy G. (2004), Dalton Trans. 2336